
源頼朝による奥州征伐で奥州藤原氏が滅亡、信夫佐藤氏が信夫荘(信夫郡の西北、松川以北)に押し込められると、鎌倉による論功行賞で、福島県内は伊達氏、相馬氏、二階堂氏、蘆名氏、畠山氏、結城氏など、多数の関東武士団に細分化されました。
南北朝の動乱においては結城氏の一族である白河結城氏が台頭し、白河結城氏を主力とする南朝方が大いに優勢となったが、しばらくすると相馬氏など北朝方が盛り返し白河結城氏など多くの諸氏は奥州管領や鎌倉公方の支配を受けるようになります。
戦国時代になると、伊達氏の伊達稙宗が南奥羽で外征や婚姻外交を繰り返し南奥羽のほとんど大名が勢力下に入るが天文の乱を起こし衰退したり、白河結城氏が衰退し代わって岩城氏が勢力を盛り返すなど、栄枯盛衰はやむことはなく、隣接する佐竹氏や上杉氏の影響も受けるようになるが、最終的には蘆名氏や相馬氏、二本松氏などを圧倒した伊達氏の伊達政宗が短期間ではあるが、福島県域の浜通りを除く大半を領有することになるのです。
豊臣秀吉による奥州仕置により伊達政宗が伊達氏の元の本領以外没収され、会津には蒲生氏郷が入植します。
翌年の葛西大崎一揆の戦後処理で伊達政宗が岩出山に移封させられると、蒲生氏郷が福島県中通り以西のほとんどを領有しました。
しかし子の蒲生秀行は会津から宇都宮に移され、代わって越後の上杉景勝が会津120万石を得て福島県の中通り以西のほとんどの地域と山形県の置賜地方を領有するのです。
関ヶ原の戦いによって上杉景勝は信夫郡伊達郡を除く福島県域の所領を失い、30万石となってしまいます。
代わって会津には蒲生秀行が再度入封し、会津藩60万石が成立します。
しかし、2代目の蒲生忠郷が早世し伊予松山藩に移ることになるのです。
次に1627年加藤嘉明が40万石で会津に入封しますが、これも2代目加藤明成で会津騒動を起こして領地を幕府に返上することになります。
そして、1643年に松平氏保科正之が23万石で入封し、この松平氏会津藩が幕末まで続くことになりました。
一方、信夫郡と伊達郡も1664年に上杉氏米沢藩から召し上げられ、会津藩以外の大藩はなくなり、会津と相馬氏領の相馬地方を除く県内のほとんどの地域で、江戸時代を通じて小藩、天領が入り乱れて激しく変遷していきました。